Sûnt it begjin fan 'e pandemy hawwe diagnostyske testen in fitale rol spile by it kontrolearjen fan de fersprieding fan SARS-CoV-2, it firus dat feroarsaketCOVID 19.Rapid antigen testsútfierd thús of yn in klinyske ynstelling jouwe resultaten yn 15 minuten of minder.De earder in persoan wurdt diagnostearre, hoe earder se kinne sykje medyske oandacht en isolearje harsels fan oaren.Mar as nije farianten fan it firus ferskine, kinne dy farianten net wurde ûntdutsen troch dizze tests.
De measte rappe antigeentests binne ûntworpen om it SARS-CoV-2-nukleocapsideprotein as N-protein te detektearjen.Dit aaiwyt wurdt fûn yn oerfloed yn virale dieltsjes en ynfektearre minsken.Rapid test kits meastentiids befetsje twa ferskillende diagnostyske antykladen dy't bine oan ferskate dielen fan it N aaiwyt.As in antykodym bynt oan it N-proteïne yn in stekproef, ferskynt in kleurde line as in oar sinjaal op 'e testkit, wat in ynfeksje oanjout.
Protein N bestiet út 419 aminosoeren strukturele ienheden.Elk fan har kin wurde ferfongen troch in oare aminosoer troch mutaasje.Undersyksgroep ûnder lieding fan Ph.D.Philip Frank en Eric Ortlund fan Emory University sette út om te ûndersykjen hoe't dizze inkele aminosoerferoaring de prestaasjes fan in rappe antigeentest beynfloedet.Se brûkten in technyk neamd djippe mutaasje skennen om tagelyk te beoardieljen hoe't elke mutaasje yn it N-proteïne fan it firus de bining oan in diagnostysk antykodyk beynfloedet.Harren resultaten waarden publisearre yn Cell op septimber 15, 2022.
De ûndersikers makken in wiidweidige bibleteek fan hast 8.000 N-proteinmutaasjes.Dizze farianten binne goed foar mear as 99,5% fan alle mooglike mutaasjes.Se evaluearren doe hoe't elke fariant ynteraksje mei 17 ferskillende diagnostyske antykladen brûkt yn 11 kommersjeel beskikbere rappe antigeentests, ynklusyf gewoanethús kits.
It team beoardiele hokker mutaasjes fan N-protein beynfloedzje antybody-erkenning.Op grûn fan dizze ynformaasje makken se in "escape mutaasjeprofyl" foar elk diagnostysk antykodyk.Dit profyl identifisearret spesifike mutaasjes yn it N-proteïne dy't ynfloed kinne op it fermogen fan it antykodym om te binen oan syn doel.De analyse liet sjen dat de antykladen brûkt yn 'e hjoeddeistige rappe tests alle ferline en hjoeddeistige farianten fan SARS-CoV-2 fan soarch en soarch erkenne en bine.
Hoewol ferskate diagnostyske antykladen deselde regio fan it N-proteïne werkenne, fûnen de ûndersikers dat elk antykodyk in unike hantekening hat fan ûntsnappingsmutaasjes.Om't it SARS-CoV-2-firus trochgiet te mutearjen en nije farianten te generearjen, kinne dizze gegevens wurde brûkt om antykladen foar testkit te flagge dy't miskien opnij moatte wurde beoardiele.
"Akkurate en effisjinte identifikaasje fan ynfekteare yndividuen bliuwt in krityske strategy foar mitigaasje fan COVID-19, en ús stúdzje leveret ynformaasje oer takomstige SARS-CoV-2-mutaasjes dy't kinne ynterferearje mei deteksje," sei Ortlund."De hjir beskreaune resultaten kinne ús rap oanpasse oan dit firus, om't nije farianten trochgean te ûntstean, en presintearje direkte gefolgen foar klinyske en folkssûnens."
Eftergrûn: Mutation Deep Scan detektearret ûntsnappingsmutaasjes yn it SARS-CoV-2-nukleocapsid mei op it stuit beskikbere rappe antigeentests.Frank F, Kin MM, Rao A, Bassit L, Liu H, Bowers HB, Patel AB, Kato ML, Sullivan JA, Greenleaf M, Piantadosi A, Lam VA, Hudson VH, Ortlund EA cell.2022 15 septimber;185(19):3603-3616.e13.Ministearje fan Ynlânske Saken: 10.1016/j.cell.2022.08.010.29 augustus 2022 PMID: 36084631.
Finansiering: Nasjonaal Ynstitút foar Biomedical Imaging en Bioengineering NIH (NIBIB), Nasjonaal Ynstitút foar Diabetes, Digestive and Kidney Diseases (NIDDK) en Nasjonaal Ynstitút foar Allergy en Infectious Diseases (NIAID), American Heart Association.
NIH Research Matters is in wyklikse update fan wichtige NIH-ûndersyksbefinings besjoen troch NIH-eksperts.It wurdt publisearre troch it Office Communications and Public Affairs fan 'e direkteur fan' e National Institutes of Health.